新型冠状病毒变异成两个“亚型”?并非实锤

新型冠状病毒变异成两个“亚型”?并非实锤
新式冠状病毒变异成两个“亚型”?并非实锤!  近来,新式冠状病毒是否变异引发重视。大众关于冠状病毒发作了什么样的变异,病毒变异是否影响它的致病性和传达力等问题发作许多疑问,科技日报记者带着这些问题咨询了多位基因组学范畴和病毒学范畴的学者。  病毒变异常见,“骤变”还未到来  “病毒变异对错常常见的,每个毒株的病毒序列都或多或少有所不同。”美国加州大学圣地亚戈分校医学中心副教授李克峰介绍,病毒毒株之间的不同和“千人千面”有着类似的道理。  日前,论文《关于SARS-CoV-2的来源和继续进化》在对百余株新冠病毒毒株的全基因组序列比对后发现,病毒在基因组上一个蛋白编码位点的骤变形成了两“组”,被媒体称为“亚型”。“现在看,这个程度的变异形成的差异不足以叫‘亚型’,叫分枝(clade)比较适宜。”有病毒专家标明,“亚型”有共同的含义,不同病毒的界说不一样,不是只需有一两个骤变就能够分出“亚型”。  相关专家标明,这个病毒刚刚发作还没多久,不行能有太大的改变,根据对病毒现有的认知,病毒的变异速率大约为每年1000个碱基中发作1个碱基的改变,只要在关键位点的改变才干导向杰出的变异。  针对新冠病毒变异会不会影响疫苗研制的问题,中国科学院副秘书长、中国科学院院士周琪回应称,现在,病毒变异并没有影响到药物研制、抗体制备和疫苗制备。在病毒变异的进程里边咱们需求更多事例,也需求更多深入研讨。现在研讨人员正在积极地观测病毒变异程度、布局科研项目。  序列同享,完成真实的大数据发掘  现在的基因序列比照研讨的样本量大多为百余例左右。李克峰以为,研讨样本量太少,并不能阐明是什么时分变异的以及是否在武汉变异的。  此外,关于冠状病毒样本的数据发掘,还应该重视代表性,例如该论文选用的数据中,武汉样本多是元旦前后,1月底前后的样本多集中于国外,还有少部分1月中旬的广东、云南的样本数据,涣散的数据很难讲通病毒繁殖、进化、传代的“故事”。  “数据数量的严峻缺少,很或许形成片面的剖析成果。”一位国家科学数据中心负责人介绍,据国家生物信息中心(国家基因组科学数据中心)树立的2019新冠病毒信息库发布的计算,现在全球揭露的新冠病毒序列有283条,其间只要200个全基因组序列。这关于数据发掘的需求而言相当于“无济于事”。  看懂病毒“习性”,需与临床数据相关研讨  上述论文中说到,新冠病毒能够分为S型和L型,前者更具侵略性,后者更温文。李克峰以为:“现在而言,病毒习性是无法根据病毒的基因序列独自判别。科学家企图探究病毒的蛋白与宿主受体结合程度来作为病毒传达力的一个判别根据,可是其致病力现在还未找到共性规则。”  一个病毒是否“凶狠”,是不是个“暴脾气”,该怎么推论?  “该论文运用序列剖析软件,对新冠病毒基因的差异进行分型,然后得到每种基因分型和患者临床表现的相关性,我以为这只能是估测性定论。”美国堪萨斯大学医学院教授董亚峰以为,把病毒变异分型后,还需求与患者的临床数据进行相关性剖析,才有现实含义。  “找基因的变异是一项非常重要的作业,但难度比较大。在几万个患者的基因中找到变异的片段,相当于难如登天。咱们不行能,也没有必要把每位患者的基因做测序,然后发现基因变异。经过挑选特别患者、不同流行病学史或不同地域的患者进行基因测序,以加速寻觅变异的基因。”董亚峰解说,比方一些特别患者,其核酸检测一直是阴性,但CT印象等临床数据倾向于阳性;医治后核酸转阴又转阳性的患者,经过对这些特别患者的基因序列剖析,与一般患者作比较,会更高效找到基因变异片段。  寻觅新冠病毒的变异不只标明人类对新冠病毒的知道深度,还有许多现实含义。董亚峰介绍,比方检测试剂盒呈现阴性或许是因为某些基因片段特定区域骤变,然后检测不到。经过发现基因变异,还能够规划出更好的核酸检测试剂盒;再比方,经过把变异和非变异基因患者的临床数据做计算剖析,能够将基因变异与病况的开展、愈后等目标做相关剖析,然后辅导更有用的精准医治。  “不同变异的病毒或许临床症状彻底不同,如果能找到规则将对临床有辅导含义。”董亚峰着重,科学研讨含义不只在发现不同,更要重视临床使用。  本报记者 张佳星 【修改:田博群】

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